Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms