Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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