Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms