Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms