Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms