Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Ssbp4Q3U4B1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
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Ssbp4Q3U4B1 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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