Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Ulk3Q3U3Q1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Ulk3Q3U3Q1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ulk3Q3U3Q1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ulk3Q3U3Q1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ulk3Q3U3Q1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ulk3Q3U3Q1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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