Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms