Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYV2

Hhla1, HERV-H LTR-associating protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hhla1Q3TYV2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 939.9 ms