Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Shcbp1lQ3TTP0 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Shcbp1lQ3TTP0 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Shcbp1lQ3TTP0 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Shcbp1lQ3TTP0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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