Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms