Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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