Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCH7

Cul4a, Cullin-4A, mousemouse

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4aQ3TCH7 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cul4aQ3TCH7 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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