Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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