Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Rpusd3Q14AI6 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Rpusd3Q14AI6 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Rpusd3Q14AI6 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Rpusd3Q14AI6 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Rpusd3Q14AI6 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Rpusd3Q14AI6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Rpusd3Q14AI6 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Rpusd3Q14AI6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Rpusd3Q14AI6 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Rpusd3Q14AI6 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Rpusd3Q14AI6 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Rpusd3Q14AI6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms