Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms