Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms