Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms