Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms