Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
AmbpQ07456 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
AmbpQ07456 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
AmbpQ07456 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
AmbpQ07456 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
AmbpQ07456 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
AmbpQ07456 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
AmbpQ07456 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms