Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Elobl-201ENSMUST00000061938 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms