Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

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Length 549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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RelaQ04207 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RelaQ04207 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RelaQ04207 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RelaQ04207 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RelaQ04207 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RelaQ04207 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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RelaQ04207 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RelaQ04207 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RelaQ04207 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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RelaQ04207 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RelaQ04207 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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RelaQ04207 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RelaQ04207 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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RelaQ04207 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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RelaQ04207 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RelaQ04207 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RelaQ04207 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RelaQ04207 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RelaQ04207 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RelaQ04207 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RelaQ04207 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RelaQ04207 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RelaQ04207 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RelaQ04207 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RelaQ04207 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RelaQ04207 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RelaQ04207 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RelaQ04207 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RelaQ04207 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RelaQ04207 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RelaQ04207 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms