Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms