Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms