Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GscQ02591 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GscQ02591 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GscQ02591 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GscQ02591 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GscQ02591 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GscQ02591 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GscQ02591 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GscQ02591 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GscQ02591 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GscQ02591 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GscQ02591 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GscQ02591 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GscQ02591 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GscQ02591 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GscQ02591 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GscQ02591 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GscQ02591 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GscQ02591 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GscQ02591 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GscQ02591 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GscQ02591 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GscQ02591 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GscQ02591 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GscQ02591 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GscQ02591 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GscQ02591 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GscQ02591 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GscQ02591 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GscQ02591 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GscQ02591 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GscQ02591 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GscQ02591 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GscQ02591 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GscQ02591 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GscQ02591 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GscQ02591 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GscQ02591 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GscQ02591 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GscQ02591 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GscQ02591 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GscQ02591 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GscQ02591 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GscQ02591 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GscQ02591 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GscQ02591 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GscQ02591 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GscQ02591 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GscQ02591 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GscQ02591 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GscQ02591 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GscQ02591 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GscQ02591 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GscQ02591 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GscQ02591 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GscQ02591 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GscQ02591 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GscQ02591 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GscQ02591 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GscQ02591 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GscQ02591 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GscQ02591 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GscQ02591 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GscQ02591 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GscQ02591 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GscQ02591 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GscQ02591 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GscQ02591 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GscQ02591 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GscQ02591 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GscQ02591 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GscQ02591 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GscQ02591 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GscQ02591 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GscQ02591 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GscQ02591 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GscQ02591 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GscQ02591 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GscQ02591 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GscQ02591 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GscQ02591 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GscQ02591 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GscQ02591 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GscQ02591 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GscQ02591 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GscQ02591 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GscQ02591 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GscQ02591 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GscQ02591 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GscQ02591 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GscQ02591 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GscQ02591 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GscQ02591 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GscQ02591 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GscQ02591 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GscQ02591 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GscQ02591 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GscQ02591 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GscQ02591 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GscQ02591 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms