Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms