Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms