Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms