Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms