Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn1bP97952 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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