Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

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Length 3,329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Brca2P97929 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Brca2P97929 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Brca2P97929 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Brca2P97929 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Brca2P97929 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Brca2P97929 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Brca2P97929 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Brca2P97929 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Brca2P97929 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Brca2P97929 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Brca2P97929 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brca2P97929 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brca2P97929 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brca2P97929 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brca2P97929 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brca2P97929 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Brca2P97929 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brca2P97929 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brca2P97929 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brca2P97929 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brca2P97929 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brca2P97929 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brca2P97929 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brca2P97929 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brca2P97929 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brca2P97929 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Brca2P97929 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Brca2P97929 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brca2P97929 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brca2P97929 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brca2P97929 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brca2P97929 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brca2P97929 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brca2P97929 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brca2P97929 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brca2P97929 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brca2P97929 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brca2P97929 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brca2P97929 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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Brca2P97929 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Brca2P97929 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Brca2P97929 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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Brca2P97929 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Brca2P97929 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Brca2P97929 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Brca2P97929 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Brca2P97929 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Brca2P97929 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Brca2P97929 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brca2P97929 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brca2P97929 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Brca2P97929 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brca2P97929 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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