Protein–RNA interactions for Protein: P97868

Rbbp6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp6P97868 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbbp6P97868 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms