Protein–RNA interactions for Protein: P97864

Casp7, Caspase-7, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp7P97864 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp7P97864 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp7P97864 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp7P97864 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp7P97864 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp7P97864 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp7P97864 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp7P97864 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casp7P97864 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms