Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms