Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Mesp1P97309 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Mesp1P97309 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms