Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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