Protein–RNA interactions for Protein: P81117

Nucb2, Nucleobindin-2, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb2P81117 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nucb2P81117 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nucb2P81117 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms