Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx3P81067 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx3P81067 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irx3P81067 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Irx3P81067 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irx3P81067 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx3P81067 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx3P81067 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx3P81067 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms