Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx2P81066 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx2P81066 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx2P81066 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx2P81066 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx2P81066 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx2P81066 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx2P81066 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irx2P81066 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx2P81066 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms