Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf3P70671 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf3P70671 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf3P70671 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf3P70671 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf3P70671 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf3P70671 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf3P70671 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms