Protein–RNA interactions for Protein: P70658

Cxcr4, C-X-C chemokine receptor type 4, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr4P70658 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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