Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms