Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfixP70257 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfixP70257 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfixP70257 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfixP70257 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfixP70257 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfixP70257 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfixP70257 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfixP70257 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfixP70257 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfixP70257 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfixP70257 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfixP70257 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfixP70257 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfixP70257 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NfixP70257 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NfixP70257 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfixP70257 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfixP70257 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfixP70257 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfixP70257 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfixP70257 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfixP70257 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfixP70257 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfixP70257 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfixP70257 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfixP70257 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfixP70257 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfixP70257 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfixP70257 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfixP70257 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfixP70257 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NfixP70257 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NfixP70257 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NfixP70257 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NfixP70257 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NfixP70257 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NfixP70257 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NfixP70257 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NfixP70257 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NfixP70257 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NfixP70257 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NfixP70257 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NfixP70257 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NfixP70257 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NfixP70257 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NfixP70257 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NfixP70257 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NfixP70257 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NfixP70257 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NfixP70257 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NfixP70257 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NfixP70257 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NfixP70257 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NfixP70257 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NfixP70257 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NfixP70257 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NfixP70257 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NfixP70257 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NfixP70257 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NfixP70257 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NfixP70257 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NfixP70257 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NfixP70257 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NfixP70257 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NfixP70257 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NfixP70257 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NfixP70257 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfixP70257 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfixP70257 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfixP70257 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfixP70257 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfixP70257 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NfixP70257 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfixP70257 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfixP70257 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfixP70257 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfixP70257 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfixP70257 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfixP70257 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NfixP70257 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfixP70257 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfixP70257 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfixP70257 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfixP70257 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfixP70257 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfixP70257 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfixP70257 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfixP70257 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfixP70257 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfixP70257 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfixP70257 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfixP70257 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfixP70257 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfixP70257 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NfixP70257 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfixP70257 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfixP70257 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfixP70257 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfixP70257 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms