Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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