Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SbdsP70122 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SbdsP70122 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SbdsP70122 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SbdsP70122 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SbdsP70122 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SbdsP70122 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SbdsP70122 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SbdsP70122 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SbdsP70122 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SbdsP70122 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SbdsP70122 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SbdsP70122 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SbdsP70122 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SbdsP70122 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SbdsP70122 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SbdsP70122 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SbdsP70122 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SbdsP70122 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SbdsP70122 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SbdsP70122 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SbdsP70122 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SbdsP70122 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SbdsP70122 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SbdsP70122 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SbdsP70122 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SbdsP70122 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SbdsP70122 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms