Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcbP68404 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms