Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Copz1P61924 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Copz1P61924 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Copz1P61924 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Copz1P61924 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Copz1P61924 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Copz1P61924 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Copz1P61924 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Copz1P61924 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Copz1P61924 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Copz1P61924 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Copz1P61924 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Copz1P61924 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Copz1P61924 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Copz1P61924 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Copz1P61924 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Copz1P61924 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Copz1P61924 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Copz1P61924 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms