Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ube2d1P61080 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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