Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms