Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms